Doğum kontrol hapları hormonal ilaçlardır ve hormon ilaçlarının bir takım hafif yan etkilerinin yanında ciddi olabilecek hayati tehdit edici yan etkileri de olabilir. Hafif yan etkilerin başında; mide bulantısı, mide bağırsak sistemindeki bozukluklar gelmektedir. Bunun yanında hormon ilaçları vücutta sıvı tuttuğu için hastalarımız genellikle sıvı tutmasından, şişkinlikten ve hafif kilo artışından şikayetçilerdir. Doğum kontrol haplarının vücutta metobolize olduğu karaciğerde eğer kadında bir problem varsa, bir karaciğer rahatsızlığı varsa, safra kesesi rahatsızlığı varsa bu tür durumlarda kullanılması çok uygun değildir.

Bundan başka migren, hipertansiyon, kanama pıhtılaşma bozukluklarında dikkatle kullanılması gereklidir. Özellikle kanama pıhtılaşma bozukluğu olan kişilerde gerekli araştırmaların yapılması ve çok gerekliyse başka türlü bir korunma yöntemi kullanılamıyorsa önerilmesi gerekmektedir. Bunun yanında çok önemli bir durumda sigara içimidir özellikle 35 yaşından sonra sigara içilmesi ve doğum kontrol hapı kullanılması kesinlikle yasak olmaktadır.